Kurahara Kakeru corre por las calles de la ciudad durante la noche y es abordado por un extraño chico en una bici que le hace una desconcertante pregunta ¿Te gusta correr? El chico, llamado Kiyose Haiji, convence a Kakeru para vivir en la residencia estudiantil Chikusei-So, donde conocerá al extraño grupo que vive en ella. La mayor sorpresa de todas, llegará cuando Haiji descubra sus verdaderos planes para tan variopinto grupo.

La intención de Haiji es que los residentes de la residencia corran juntos en la Hakone Hekiden, una carrera de larga distancia. Todos se niegan a tan disparatado plan, pero ante la insistencia posterior de Haiji, algunos sucumben a la presión y acaban aceptando. Kakeru se niega en redondo, hasta el punto de abandonar la residencia.

Haiji consigue convencer a Kakeru, que aún tiene dudas y comienzan los entrenamientos. Sin embargo, algunos residentes continúan negándose en redondo y Haiji deberá ponerse creativo. Una misteriosa joven aparece ante Kakeru.

Un viejo compañero del club de atletismo del instituto se presenta ante Kakeru. Sakaki despierta viejos recuerdos de soledad e impotencia en Kakeru, que comienza a desmoronarse ante el peso de su pasado. Cuando está a punto de sucumbir, es salvado por Principe y los demás.

La aparición de Sakaki ha unido al grupo. Sin embargo, Kakeru sigue albergando las mismas dudas, ya que son sólo un montón de aficionados sin las bases necesarias y el tiempo les devolverá a la realidad. Haiji comienza con entrenamientos individuales, pero King continua negándose a participar.

Shindo está preocupado por King, que ante la insistencia de Haiji y su incapacidad para conseguir trabajo, comienza a sentirse muy presionado. Kakeru visita a Nico para preguntarle sobre Haiji, buscando respuestas que le ayuden a disipar sus dudas.

Los residentes de Chikusei-So, se presentan a su primera carrera oficial en la Tokyo Sport University. Una vez allí, aparece Sakaki con la intención de provocar a Kakeru. Cuando Haiji intenta detener el enfrentamiento, aparece un viejo amigo y compañero de Haiji, dejando a todos petrificados. Se trata ni más ni menos que del actual campeón de la Hakone Hekiden y as de la Rikudo University, Fujioka Kazuma.

Chikusei-So experimenta una aplastante derrota. Kakeru revienta cuando sus compañeros de equipo comienzan a quejarse y elogiarse, sin un ápice de autocrítica. Kakeru y Nico deciden entrenar por su cuenta y Príncipe busca una forma de leer manga mientras entrena.

Kakeru le pide a Príncipe que abandone el equipo si no mejora su rendimiento en la próxima carrera. Haiji considera ineficaz la postura de Kakeru y Príncipe se pregunta si podrá conseguir un tiempo oficial. Haiji descubre que alguien está ayunando.

Haiji se desmaya y queda convaleciente. Es entonces cuando todos se dan cuenta de lo mucho que hace Haiji por ellos y por el equipo. El equipo decide elegir un capitán sustituto y Kakeru intenta ayudar a Príncipe a mejorar, aunque ambos siguen sin reconciliarse.

Musa y los gemelos consiguen al fin sus tiempos oficiales. Yuki y Shindo, a pesar de alegrarse por sus compañeros se sienten frustrados y ni siquiera Haiji consigue animarles. Shindo se esfuerza de más en los entrenamientos y los estudios y preocupa al resto. Mientras, la lluvia dificulta el entrenamiento del equipo.

Comienza una nueva carrera, esta vez en la Universidad de Kansei. Kakeru se enfrenta directamente a los alumnos de intercambio, en una carrera vertiginosa. Shindo y Yuki se esfuerzan por conseguir un tiempo oficial. Después de la carrera, un reportero de la revista Shinjitsu se presenta ante el grupo.

El grupo se encuentra de campamento de entrenamiento en el lago Shirakaba, donde se encuentran con Sakaki y su equipo. Sakaki se ensaña con Kakeru y este último pierde los papeles e intenta agredirle. Kakeru se consume por dentro mientras recuerda su pasado y como se destruyó a sí mismo y a su equipo de secundaria.

El grupo acepta el pasado de Kakeru y continúan con el entrenamiento en el lago. Al volver a la ciudad, comienzan a buscar fondos para el club de atletismo y reclutar miembros para el club de fans. Poco a poco, los miembros del club de atletismo de la Universidad de Kansei comienzan a parecer atletas de verdad y el sueño de la Hakone Hekiden no parece tan lejano.

Todos han conseguido sus tiempos oficiales y por fin podrán participar en las clasificatorias de la Hakone Hekiden. De un día para otro, reciben el reconocimiento de la universidad, de los alumnos, de los fans e incluso de los medios de comunicación, lo que aumenta las expectativas del grupo con respecto a la Hakone Hekiden.

La caída accidental de un corredor durante la carrera, provoca que al esquivarlo, Haiji apoye todo su peso sobre la pierna mala y hace sonar todas las alarmas. La lluvia hace acto de presencia y golpea sin piedad a los participantes, que luchan desesperadamente por hacer sus mejores tiempos y clasificar a su equipo para la Hakone Hekiden, cuando la carrera llega a su punto álgido.

El club de atletismo de la Universidad de Kansei ha conseguido su clasificación para la Hakone Hekiden de forma milagrosa. A raíz de esto, comienzan a llamar la atención de posibles nuevos miembros y de los medios de comunicación, pero Haiji prefiere centrarse en la carrera. Los gemelos comienzan a comportarse de forma extraña.

Mientras Kakeru camina de regreso a casa con Musa, se encuentran con Fujioka Kazuma, el campeón de Rikudo. Fujioka les cuenta parte de la historia que comparte con Haiji y Kakeru siente por fin que entiende algo mejor el concepto de "ser fuerte" que Haiji le describió. Mientras tanto, Haiji tiene problemas.