Debido a un atentado terrorista en la ciudad de Caprica, Daniel Greystone y Josep Adama tratan de recuperar a sus fallecidas hijas a través de un software capaz de duplicar el cerebro humano ideado antes de morir por Zoe, la hija de Greystone. Para ello Adama deberá conseguir una pieza tecnológica en posesión de la compañía rival de Greystone. Esta pieza sera la clave para el desarrollo del primer Cylon.

Daniel cree que su intento de transferir el avatar de Zoe a un ser cibernético ha fallado, pero su sentimiento de fracaso se ve compensado cuando su otro proyecto, el de los robots inteligentes, empieza a prosperar.

Los Graystone empiezan a pagar el precio del discurso público de Amanda en el que exclamaba que Zoe era uno de los terroristas que hicieron estallar el tren. Joseph Adama, por su parte, sigue insistiendo en que quiere visitar al holograma de su hija.

Daniel Graystone cede ante los expertos en relaciones públicas de la compañía y decide acudir al programa nocturno para hablar de lo que hizo Zoe. La aparición de Daniel en televisión no empieza bien, pero obtendrá ayuda de una fuente inesperada.

El avatar de Tamara Adama descubre el V-World, asustada, perdida, y desconocedora de que falleció un mes antes en el atentado del MagLev. Juntándose con un grupo de jugadores, Tamara descubre un lado nuevo del V-World, New Cap City, un lugar donde la gente vive virtuales existencias de violencia y crímen.

El rival financiero de Daniel, Tomas Vergis, le acusa del robo de los procesadores meta-cognitivos y del asesinato de los dos trabajadores durante el asalto. No obstante, su sentido de la venganza difiere de la que Daniel pueda imaginarse. Keon acompaña a Lacy al encuentro con Barnabas Greeley, líder del grupo de los Soldados Del Único.

La hermana Clarice redobla sus esfuerzos por ganarse la confianza de Amanda Graystone y conseguir así el avatar de Zoe. La doctora, mientras tanto, tiene varias visiones de su hermano Darius, que murió en un accidente de tráfico varios años antes. En el mundo virtual, Zoe sigue adelante con su romance con Philomon, el científico que trabaja para su padre. La joven tiene la esperanza de que le ayude a transportar el cylon en el que se encuentra atrapada hasta Gemenon. Por otro lado, el intento fallido de Lacy de reclutar a Barnabas para su causa provoca tensiones entre ella y Zoe. Joseph Adama, por su parte, logra dar con Heracles, el chico que introdujo a Tamara en New Cap City, y le convence para que le ayude a encontrar a su hija. Ambos se adentran en las calles del juego, pero Heracles es asesinado, lo que deja a Adama solo en su búsqueda de Tamara. En la empresa de Graystone, finalmente, todo son problemas: Tomas Vergis sigue acosando a Daniel y le dice que el chip MCP nunca le funcionó.

Joseph y Emmanuelle buscan a Tamara en el equivalente digital del hogar de los Adama, pero el apartamento se encuentra ahora habitado por un drogadicto. Pero mientras el nuevo inquilino les explica que la joven se encuentra en un club llamado Mysteries, una banda de narcotraficantes armados hace su aparición, amenazando a Adama. Por otro lado, en el mundo real, Amanda sigue teniendo visiones de su hermano muerto. La mujer decide volver al lugar del accidente para resolver el misterio de su accidente. Más tarde, Amanda abre su corazón a Clarice y se lo explica todo, situación que la docente aprovecha para manipularla y llegar al avatar de Zoe. Además, la desesperación de Daniel aumenta, así como sus métodos. Aprovechando el temor de su hija al fuego, el científico obliga al cylon U-87 a mantenerse quieto mientras prepara una enorme pira a su alrededor. Zoe insiste a Lacy en que se dé prisa en llevársela de Caprica antes de que haga daño a su padre.

Los problemas económicos aprietan tanto a Daniel Graystone que se ve obligado a vender su querido equipo de pirámide a su rival, Tomas Vergis. El Departamento de Defensa, además, acaba de descubrir que el chip que posibilitó la creación de los cylon es robado, pero le da una semana al científico para que termine el proyecto. No sabe que, paralelamente, el ministerio también está tanteando un contrato con Vergis. Daniel pide a Philo que someta al chip a una radiación especial que posibilitará la copia en masa del dispositivo sin errores. El joven está a punto de hacerlo cuando Zoe le revela su verdadera identidad. Esto tendrá consecuencias desastrosas para Philo. A continuación, la chica roba una furgoneta y huye del laboratorio. Por otro lado, Lacy se encuentra ultimando los detalles del cargamento con Barnabas cuando descubre, con sorpresa, que el hombre planea detonar una bomba: la que la propia Lacy colocó en el coche de la hermana Clarice.

Daniel Graystone busca una alianza empresarial con el sindicato del crimen Ha'la'tha, mientras Clarice se encuentra con varios líderes religiosos que buscan crear un paraíso virtual. Por su parte, Zoe sigue buscando a Tamara.

Daniel Graystone se dispone a reclamar su empresa cavando en el oscuro pasado de los miembros de la compañía. El detective que investiga el caso de los asesinatos de los estudiantes sospecha de Clarice. Y Lacy escapa con las bombas en una huída en coche frenética.

Daniel recupera su puesto como CEO de la compañía gracias a un voto anónimo, pero Adama le advierte de que Vergis seguirá presionándole a menos que muera. Daniel se niega a acabar con él y le invita a negociar a su casa, donde el empresario le pide él mismo que lo mate, porque no conseguirá dejar Caprica con vida. Daniel le ofrece que se una a él y se enfrenten a los Ha'la'tha.

Mientras Daniel Graystone recibe presiones para terminar de desarrollar su programa, las cosas se complican en su compañía a medida que aumenta el contrabando de cylons. Por otro lado, su esposa sigue espiando a la Hermana Clarice.

El Guatrau da a Daniel Graystone dos semanas para que complete su programa de resurrección y, paralelamente, ordena a Sam Adama que lo mate después de finalizarlo.

Un 'flashback' a los tiempos de la primera rebelión de Tauron revela cómo varios soldados de Herac entran en casa de los Adama para investigar el asesinato de un militar. Cuando encuentran un arma robada por Sam, apalizan a William Adama y matan a su mujer. Joseph y Sam son testigos de todo desde una habitación oculta y, más tarde, William pide a Sam que le dispare y acabe con su sufrimiento.

Amanda y Daniel deciden buscar a Zoe en el mundo virtual. Daniel es el primero en introducirse allí, pero su hija lo apuñala y lo manda de vuelta a la realidad. El hombre jura que encontrará la manera de volver, a pesar de que quien muere en New Caprica City no puede regresar al juego.

Los Graystone se introducen en el mundo digital y se reúnen con Zoe. Clarice y sus maridos irrumpen en la residencia del matrimonio con la intención de asesinarlos y hacerse con la holobanda.

Tras el intento fallido de Clarice de asesinar a los Graystone y hacerse con la holobanda, Gara Singh se le acerca y le dice quién es en el GDD y en el mundo virtual. El hombre también le dice que hará el anuncio falso de que los Graystone son los terroristas que metieron a Zoe en el tren bomba.